AmpC Number Accession -31 -30 -29 -28 -27 -26 -25 -24 -23 -22 -21 -20 -19 -18 -17 -16 -15 -14 -13 -12 -11 -10 -9 -8 -7 -6 -5 -4 -3 -2 -1 0d 0c 0b 0a 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 125a 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 204a 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 247a 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 Secondary Structure Diagram Consensus Secondary Structure H H H H H H H H H H H H H H H H H T S E E E E E E E E T T E E E E E E E E E E E T T T T E E T T E E E G G G H H H H H H H H H H H H H H T T S T T S B G G G G G G G T T S G G G B H H H H H T T S S S S T T S H H H H H H H H H H S S T T S E E H H H H H H H H H H H H H T T S H H H H H H H H/T H/T H H H T T T T B S S G G G G G G B E E E E T T H H H H H E E H H H H H H H H H H H H G G G H H H H H H H H H H H T E E E E E T T E E E S S E E E E S S H H H H H H H T S H H H H S E E E E E E E E E S S E E E E E E E E S S E E E E E E E G G G T E E E E E E E S B H H H H H H H H H H H H H H Helix Number H1 H1 H1 H1 H1 H1 H1 H1 H1 H1 H1 H1 H1 H1 H1 H1 H1 H2 H2 H2 H2 H2 H2 H2 H2 H2 H2 H2 H2 H2 H2 H3 H3 H3 H3 H3 H4 H4 H4 H4 H4 H4 H4 H4 H4 H4 H5 H5 H5 H5 H5 H5 H5 H5 H5 H5 H5 H5 H5 H6 H6 H6 H6 H6 H6 H6 H6 H6 H6 H6 H6 H7 H7 H7 H7 H7 H8 H8 H8 H8 H8 H8 H8 H8 H8 H8 H8 H8 H9 H9 H9 H9 H9 H9 H9 H9 H9 H9 H9 H10 H10 H10 H10 H10 H10 H10 H10 H10 H10 H10 H11 H11 H11 H11 H11 H11 H11 H11 H11 H11 H11 H11 H11 H11 Important Features ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 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H A - W R E A L T A T H V G Y Y K A G A F T Q D L M W E N Y P Y P V K L S R L I E G N N A G M I M N G T P A T A I T P P Q P E L R A G W Y N K T G S T G G F S T Y A V F I P A K N I A V V M L A N K W F P N D D R V E A A Y R I V Q A L D K R - - - - - - - TRU-1 WP_042027926.1 M K Q R I A L S L L A L G P L L L V P R V Y A - - - - - - - A A D E P M A N I V E K A V Q P L L E E Y R I P G M A V A V L K E G K P H Y F N Y G V A N R E S G R R I S E R T L F E I G S V S K T F T A T L G T Y A V V K G G F R L D D K V S Q H A P W L Q N S A F D R V T M A Q L A T Y S A G G L P L Q F P D A V - D S N E R M R Q Y Y R Q W S P L Y A A G T H R E Y S N P S I G L F G H L A A S T L G Q P F R Q L M S Q T L L P K L D L Q H T Y L E V P D A A M V D Y A Y G Y S K E D K P V R V N P G V L A D E A Y G I K T S A A D L I K F V G A N M T G S G ? D ? K A - V Q Q A L A M T R T G F Y S V G E M T Q G L G W E S Y A Y P V T E Q A L L A G N S P A V S F K A N P V K P F V A P R V M G N E R L Y N K T G S T N G F G A Y V V F V P A R G V G I V M L A N R N Y P I E A R V K A A Y A I M R H L A P - - - - - - - - Notes 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 3 4 5 6 7 8 9 9 10 13 13 13 15 11 11 14 14 12 12 12 ID Type Residues Notation 0 General -31 to -1 Signal Peptides receive negative numbers 1 General 0d to 6 Not all sequences start at the same SANC number. Use caution and/or the provided Hidden Markov Model when aligning novel sequences. 2 Deletion 116 "ACC-1, CMA-1, CSA-1, PAC-1, SRT-1, SST-1" 3 Insertion 125a PDC-1 4 Deletion 126 LRA-10 5 Insertion 204a "ACC-1, ADC-7, AQU-1, B. multivorans AmpC1, CepH, CepS, CMA-1, CSA-1, FOX-4, LHK-1, LRA-10, M. smegmatis AmpC, MOX-1, OCH-1, PAC-1, PDC-1, SRT-1, SST-1, TRU-1" 6 Deletion 243 "AQU-1, CepH, CepS, FOX-4, MOX-1, TRU-1" 7 Deletion 245 "ADC-7, ADC-8, AQU-1, B. multivorans AmpC1, CepH, CepS, CMA-1, CSA-1, FOX-4, LHK-1, LRA-10, LRA-18, M. smegmatis AmpC, MOX-1, OCH-1, PAC-1, PDC-1, SRT-1, SST-1, TRU-1" 8 Insertion 247a ACC-1 9 Deletion 289 - 290 ACC-1 10 Deletion 301 DHA-1 11 Deletion 301 - 302 AQU-1 12 Deletion 301 - 303 MOX-1 13 Deletion 304-306 ADC-7 14 Deletion 305-306 M. smegmatis AmpC 15 Deletion 311 LRA-18 Key Feature Color Key Secondary Structure Color Key Regional Annotation Color Key Active Site - Ser64 and Lys67 ?-Helix (H) ? Consensus ?-Loop Y(S/A)N Loop - Tyr 150 Bend or Turn (S/T) ? Possible extent of ?-Loop KTG Region - Lys 315 ?-Strand or ?-Bridge (E/B) R2 Consensus R2-Loop Signal Peptide 310-Helix (G) R2 Possible extent of R2-Loop - Residue not present Even split between two structures H1 Helix Number ? Residue deleted No Defined Secondary Structure